neuroConstruct 1.6.0

Lisans: Ücret -siz ‎Dosya boyutu: 50.00 MB
‎Kullanıcı Derecelendirmesi: 3.5/5 - ‎2 ‎Oy

neuroConstruct UCL Nörobilim, Fizyoloji ve Farmakoloji Bölümü'nde Silver Lab geliştirilmektedir. neuroConstruct, biyolojik olarak gerçekçi nöronların karmaşık ağlarının gelişimini kolaylaştırmak için tasarlanmıştır, yani dendritik morfolojileri ve gerçekçi hücre zarı iletkenlerini içeren modeller. Java'da uygulanmakta ve nöron ve GENESIS simülatörleri için, geliştirmenin ileri aşamalarında diğer simülasyon platformları (PSICS, MOOSE ve PyNN dahil) desteği ile komut dosyası dosyaları oluşturur. MorphML, ChannelML ve NetworkML dahil olmak üzere en son NeuroML özelliklerini kullanır. Bu yazılımın geliştirilmesi Wellcome Trust, Tıbbi Araştırma Konseyi ve AB Sinaps Projesi'nin finansmanı ile mümkün hale getirilmiştir. NeuroConstruct'ın bazı temel özellikleri şunlardır: * neuroConstruct GENESIS morfoloji dosyaları ithal edebilir, NEURON, Neurolucida, SWC ve MorphML formatında tek hücre veya ağ modelleri dahil etmek için, ya da daha soyut hücreler de el ile inşa edilebilir. * 3D konumlandırılmış iletkenlik tabanlı nöronların ağlarının oluşturulması * Hücre grupları arasındaki karmaşık bağlantı desenleri ağlar için belirtilebilir * Simülasyon komut nöron, GENESIS, MOOSE, PSICS ve PyNN tabanlı simülatörleri için oluşturulabilir (not: her proje her simülatör için oluşturulabilir) * Biyofiziksel olarak gerçekçi hücresel mekanizmalar (sinapslar/ kanal mekanizmaları) yerel komut dosyası dosyalarından (*.mod veya *.g) içe aktarılabilir veya ChannelML kullanarak şablonlardan oluşturulabilir * NöroKonstrüktasyonda simülasyon verilerini kaydetmek ve verilerin görselleştirilmesi/analizi için otomatik kod üretimi * Kaydedilen simülasyon çalışır görüntülenebilir ve Simülasyon Tarayıcı arayüzü üzerinden yönetilebilir * Python tabanlı komut dosyası arabirimi, hücre ve ağ modeli optimizasyonu için birden fazla simülasyonun çalıştırılmasına izin vererek, model oluşturma ve yürütmeyi denetlemek için kullanılabilir

sürüm geçmişi

  • Sürüm 1.6.0 tarihinde gönderildi 2012-08-23

Program Detayları